سید محمدمهدی میرباقری (زادهٔ ۱۳۴۰ در قم)، روحانی ایرانی، رئیس فرهنگستان علوم اسلامی قم و از نظریه‌پردازان در باب نسبت بین علم و دین است. او معتقد به جهت‌داری علوم از نظر معرفت‌شناختی است که براساس آن می‌توان علوم را به دینی و غیردینی تقسیم کرد.
از مهم‌ترین اساتید او در فقه و اصول میرزا جواد تبریزی، وحید خراسانی، محمد تقی بهجت، زنجانی و سبحانی و در منطق و فلسفه حسن‌زادهٔ آملی، عبدالله جوادی آملی، محمدتقی مصباح یزدی و سید منیرالدین حسینی الهاشمی را می‌توان نام برد
وی منتخب مردم البرز در مجلس خبرگان می باشد
کتاب‌شناسی
رویکردی نو در پایگاه وضع و دلالت‌های زبانی (۱۳۸۱)
جهت‌داری علوم از منظر معرفت‌شناختی (مناظره) (۱۳۸۷)
گفتارهایی پیرامون تحول در علوم انسانی (۱۳۸۹)
بینش تمدنی، تقریری از کلام اجتماعی سید محمدمهدی میرباقری ۱۳۹۳)
جستارهایی در معانی ولایت فقیه (۱۳۹۴)
نسبت اخلاق و فناوری اطلاعات (۱۳۸۶)
هنر، دین، تجدد (۱۳۹۴)
